此外厘革原本内外枢密院，此后枢密使不再由中官担当，统一合并为新的“枢机院”，权责也发生极大变化，按陆贽的构想，便是枢机院便是“帝国军事领导机构”，下设兵符司、参谋司、皇城司、按察司、教习司及供军司共六司，而此后除去沿边的重镇行省还保留管领军归行中书省平章事的鱼符调动外，腹地行省的军伍则统一归枢机院管辖，也即是说朝廷控制的诸多方镇镇兵，要逐渐和禁军合流，置于枢机院下，成为新型的唐帝国国防军。至于兵部，此后主要的职责便是选拔军事人才，更迭武庙内的人选，刊印军事理论，研究军事装备等，不会负责后勤和征伐了。
当然枢机使的人选，也经过了相对激烈的讨论。
皇帝瞩意高岳或即将服阙归来的贾耽。
但高岳却再次谦逊谢绝，称枢机院刚刚组建，权责还在摸索当中，臣岳就任淮海行中书省平章事，既然不能同时处理枢机院事务，那么和尸位素餐有何区别？不妨由陆贽暂且兼任枢机使，待到来年结束后，就直接由贾公接手。
而皇帝的内供奉官依旧，如谏议大夫、拾遗补阙和御史台，可以由皇帝直接下敕择选提拔，既要规劝皇帝，也充当皇帝的风宪耳目，这也算是高岳坚持的结果，要给皇帝留下“尊严”，即适当的参政议政的权力。
简而言之，此后帝国中央政统，实则是由四个系统的大臣掌控的，宰堂首相便是“堂公”，他是政务中枢；尚书仆射依旧是政院的“都公”（尚书仆射所在的尚书省办公厅堂叫都堂），他是管政务执行下达的；枢机院的枢密使则是“枢公”，管军事的；当然御史台的御史大夫、御史中丞还有首席侍御史，仍然叫“端公”，但此公和先前的三公相比，权力已大为缩水，只能说是敬陪末席。
其实陆贽还想对皇帝的禁内系统进行大刀阔斧的改革，如遣散冗余的宫人，让她们自由嫁人，且压制中官集团等，不过高岳又劝他说，凡事不可操之过急，以免反扑力量过大，陆贽这才作罢。
当然这些不过是贞元新政的第一个层面。
陆贽的想法，还有思想上的革新，也就是借助皇帝的封禅为由头，重新删定“五经五礼”，这才是真正的“超百王而独得”的根本，不过此事不是一朝一夕所能得的，现在做的，便是召集全国精通礼制的人士，若集贤院的知院陈京，正在婺州和信州就职的柳冕、陆淳，及刚刚括书归来的胡锡晋，还有柳宗元、刘禹锡、李绛、韩愈等新秀们，集体推进此事。
至于当务之急，陆贽在紫宸殿内宣布，便是：
“皇政复古，尊王攘夷，建省拓殖，版籍奉还！”
这十六个字掷地有声，回荡梁柱。
紫宸殿内，所有的常参官们，无论文武，无不竦然起敬，集体对御座上的皇帝长拜下来。