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机器大帝，因为尼奥在锡安虚拟世界引发的变数，而不得不活跃起来。
它的意志与作为母体管理员和代表的母体之父“设计师”、母体之母“祭师”紧密相连，因此它所做的一切，也可以看作是这两位大拿间接做的。
故而，最近一些时间母体之父的注意力基本上就存在机器大帝那一边的。
可是，现在意外的警报，让母体之父又再一次注意到了尼奥，那个失控的不稳定因素。
最近，这个尼奥似乎使用了不知名手段直接越过了防火墙，对母体进行入侵并直接从里面捞人。
这让母体之父已经多次升级了防火墙，这也使得尼奥入侵难度越来越大，或许也因此让尼奥意识到这样下去不行，这才回醒过来应该救墨菲斯了。
至于锡安虚拟世界？那个已经被尼奥控制了核心的虚拟世界，连机器大帝现在也只能被动了，更别提单单只是母体之父了。
说实话，尼奥的存在是必须的，但现在却成了一个难以处理的家伙。
若是能够销毁的话，母体之父早就自己动手了。
可惜不能，从电影原著中就可以得出这个结论来。
现在，尼奥要来救走人质墨菲斯了，母体之父也不知道应不应该全力派出人手去，毕竟他可是清楚这个救世主程序是如何觉醒的。
一旦打击过头了，把尼奥真的干掉了，反倒是会让尼奥觉醒成为真正的救世主程序的。
最后，母体之父决定不作为，先按照原本的计划来做算了，就当尼奥没有变异。
现在，母体之父因为把注意力放在机器大帝的新玩具上，对尼奥的在意程度下降了，否则这一次他或许当真会亲自出手了。
若是母体之父真的出手，哪怕杀不掉尼奥，把他关起来应该还做得到的。
尼奥现在还在攻击再攻击，他还不清楚母体之父对他的态度变化了，只是还以为自己是特殊的，所以他认真再认真，反而激发了潜力，在战斗中表现得越来越强。
这一次哪怕母体之父不出手，但是因为之前尼奥的作为，使得现在这边的防御力量远远超过了电影原著，真的打起来还是很吃力的。
崔妮蒂面对似乎源源不断跑出来的警察、保安和黑衣特工，她虽说也因为代码种子有所提升，可是还是打得相当的累。
三个地球人在此，就完全只是打酱油了。
指望三个新训练出来的家伙，能够发挥多少作用，尼奥也不会那么天真。
不过，尼奥之所以带他们来此，也是源于自己的直觉，总觉得这几个特殊的人类会帮助到他。
另一边，虽然被关了时间更为长久，比电影原著中要长得太多太多了，墨菲斯却也因为代码种子的原因，使得一般的手段无法使用到他身上，被保护得好好的。
现在一旦得到了机会，他自然就跟电影原著中一般趁乱挣断了手铐，成功逃了出来。
墨菲斯是真正的精英，黑衣特工根本不应该小看他。
所有的主力都派去对付尼奥了，看守墨菲斯的人甚至比电影原著中还来得少。
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